Težave v nosečnosti in nadaljnjem življenju pa ne predstavlja sama bolezen, ampak njeno agresivno vseživljenjsko zdravljenje in konkretne dolgoročne posledice, tako za otroka kot zdravje matere.
Številna zdravila, ki se predpisujejo za zdravljenje multiple skleroze (Avonex, Betaseron, Rebif, Copaxone, Novantrone,…) se zaradi morebitnih škodljivih in nevarnih vplivov za zdravje zarodka in ploda med nosečnostjo ne sme predpisovati in jemati. Tudi med dojenjem se je jemanju teh zdravil bolje izogniti.
Nekatera zdravila za lajšanje in zdravljenje simptomov multiple skleroze, pa se lahko jemlje tudi med nosečnostjo (Glatiramer acetat ali Copaxone).
Za podrobnejše informacije in uspešnost zdravljenja multiple skleroze med nosečnostjo pa se je potrebno posvetovati z nevrologom in ginekologom.