Vzroki za nastanek avtizma še niso znani in se še vedno raziskujejo. Dr. Stephen Dager, University of Washington of Medicine je skupaj s sodelavci primerjal odzive 60 avtističnih otrok, 16 otrok z zaostankom v razvoju in 10 normalno razvitih otrok. S pomočjo magnetne resonance (MR) so izmerili T2 dimenzijo sive in bele snovi v korteksu.
S to metodo so ugotovili prisotnost vode v možganskem tkivu, ki daje indirektno informacijo o zrelosti možganov. Rezultati so pokazali, da so možgani avtističnih otrok približno 10% lažji. Obdukcije kažejo na prisotnost citokinona v možganih avtističnih otrok, kar bi lahko podprlo verjetnost vnetnih procesov kot povzročiteljic avtizma.